在阿笠博士等待高木警官和佐藤警官到来这段期间，在东京铁塔展望台楼层上，正上演着一场天王山对峙。
柯南和水谷浩介与本上和树三人相互对峙着。
最后一个要死亡的人，其实是水谷浩介。
而这一连串的命案，并不是水谷浩介犯下的，而是本上菜菜子的哥哥，本上和树犯下的。
而本上和树的杀人动机就是为了为妹妹报仇。
不过真相是当时本上菜菜子并不是被赶出来的，而是自愿出来的。
本上和树难以释怀妹妹的善良而谎称妹妹是被7人赶出电梯，企图诱使水谷浩介进行复仇。
但是水谷浩介拒绝了本上和树。
于是本上和树自己动手并嫁祸于水谷浩介。
而水谷浩介为了减轻自己的负罪感答应帮助本上和树承担罪名，并且最后自杀。
本上和树皱着眉头看着柯南：“你究竟是什么人？”
柯南双手插兜，一副谁也不爱的模样回答道：“江户川柯南，是一个侦探。”
就在此时。
爱尔兰伪装的松本清长，已经带人进入了东京塔内。
爱尔兰故意走在后面，以迅雷不及掩耳之势，偷袭将所有的带进来的警察打晕。
而在米花森林公园，高木警官和佐藤警官进入了木屋，发现了被辣椒水喷了一脸，再次昏迷的松本警视。
而这也验证了之前佐藤警官所有的猜想都是正确的。
...
东京塔内。
在柯南的推理劝说下，水谷浩介已经不想自杀将所有的罪名揽到自己身上了，并且希望本上和树自首。
然而恼羞成怒的本上和树拿出了匕首捅向柯南。
这时候。
一声枪响响起。
躲在暗处的爱尔兰伪装的松本警视出现，开枪打掉了本上和树手上的匕首，拿出了警察手册，走到了本上和树的面前：“我是警视厅的松本，请你跟我到署里走一趟。”
爱尔兰打算从本上和树身上拿到记忆卡后，再来收拾柯南。
柯南立即打开手表上的瞄准镜，对准了爱尔兰，按下按钮，麻醉剂疾驰而去。
然而巧合的事情发生了。
爱尔兰弯腰想要把本上和树抓起来，麻醉针没有射到爱尔兰身上，而是射到了身后的水谷浩介的身上。
水谷浩介马上昏迷了过去。
柯南心里暗道一声不好。
因为水谷浩介的昏迷倒下，爱尔兰看向了柯南，本上和树抓准了机会，掏出了一个电击棒电向爱尔兰。
爱尔兰一拳头砸向了本上和树的腹部，直接让本上和树物理昏迷。
柯南凝重的看着爱尔兰：“果然，你就是爱尔兰。”
爱尔兰顶着松本清长的脸，朝着柯南露出了一个嚣张的笑脸。
爱尔兰将手枪对着柯南，然后把本上和树身上的东西都拿了出来，从里面找到了记忆卡。
柯南严肃的问道：“松本管理官人呢，该不会...”
“不，他还活着，因为我还得靠他当替身，替我抗下所有的罪名。”
爱尔兰看着记忆卡的编号，确认了记忆卡就是组织在寻找的记忆卡。
柯南看着爱尔兰手中的记忆卡问道：“那就是储存了组织卧底的记忆卡是吧。”
“看来你从金麦酒那个家伙身上得知了很多消息嘛，没错，这就是那张记忆卡。”
柯南有些懵，明明是贝尔摩德告诉他的，怎么扯到神谷皆月身上了。
爱尔兰给自己倒了一杯酒：“你是什么时候发现我是冒牌货的，我的身份，金麦酒那家伙应该不知道才对。”
柯南推理道：“隐隐约约有猜到，既然不是派擅长变装的贝尔摩德，而是派遣其他人潜入的话，就表示对象的体型跟她相差太多，所以假扮不了，这么一想，身材魁梧的松本管理官，就成为了头号嫌疑犯。”
爱尔兰气定神闲的喝了一口红酒：“原来如此，不愧是高中生名侦探，工藤新一啊。”
柯南心里一咯噔，果然爱尔兰已经知道了他的真实身份。
爱尔兰优雅的摇了一下红酒杯后继续说道：“在确认指纹为止，我本来也半信半疑的，毕竟这事对于任何人来说，也太过于匪夷所思了，谁能想到一个高中生会因为药物要变成了小学生呢。”
柯南询问道：“你向你们老大报告了吗？”
“我还没有告诉任何人，你对于我来说非常的重要，我要利用你来铲除金麦酒和扳倒琴酒。”
“用我来铲除神谷和扳倒琴酒？”
柯南彻底懵了，自己什么时候这么有用了，能直接铲除神谷皆月和扳倒琴酒，他怎么不知道？
“当初金麦酒曾杀死了一名犯错的组织成员，还把他的尸体扔在杯户饭店的大火中，烧得尸骨无存，而那位组织成员，我一直把他当做父亲一般仰慕，而且琴酒却眼睁睁的看着金麦